Panel v levé části okna programu. Je v něm zobrazována hierarchická struktura informací o čtečkách, kartách, klíčích a certifikátech. Pro uživatele strom znázorňuje stručný přehled nad všemi nalezenými informacemi. Podrobnější informace o jednotlivých položkách lze kliknutím zobrazit v okně s informacemi.
Hierarchie stromu používá 4 úrovně:
Pohybem ve stromu se aktualizují informace v okně s informacemi, ale také se aktivují a deaktivují příslušné volby menu. Jestliže např. uživatel ve stromu zvolí čtečku, nejsou dostupné operace s certifikáty, při výběru klíče nelze provést export certifikátu apod.
Kliknutím pravého tlačítka myši se pro některé položky stromu zobrazí kontextové menu, které lze použít pro rychlejší přístup k jednotlivým operacím.
viz také okno s informacemi.